選擇基本培養(yǎng)基時，除待培養(yǎng)植物的基因型外，通常應考慮培養(yǎng)基的種類，其總離子濃度、總氮水平及氮源種類（硝態(tài)氮和銨態(tài)氮）與比例、鈣和氯化物的含量等。草本植物組織培養(yǎng)廣泛使用的MS培養(yǎng)基，而木本植物組織培養(yǎng)通常采用低鹽基本培養(yǎng)基如1/2或1/4MS或WPM（Woody Plant Medium，木本植物培養(yǎng)基）。除總離子濃度外，總氮水平、氮源種類（硝態(tài)氮和銨態(tài)氮）與比例也對組織培養(yǎng)影響甚大，因此根據(jù)具體情況改變基本培養(yǎng)基的氮源類型和濃度，可以提高培養(yǎng)效果[15~17]。

   不同基因型可能需要不同的基本培養(yǎng)基，但同一種植物在培養(yǎng)的不同階段或適用于不同的培養(yǎng)目的時，所需基本培養(yǎng)基也不同。通常按培養(yǎng)階段和目的可劃分為啟動或誘導培養(yǎng)基、增殖培養(yǎng)基、生根培養(yǎng)基等多種，這種劃分可能僅僅是激素的調(diào)整，或同一基本培養(yǎng)基某些成分的改變，甚至基本培養(yǎng)基種類的不同。如大多數(shù)植物在生根培養(yǎng)時使用1/2~1/4 MS或其他低鹽培養(yǎng)基如White培養(yǎng)基，體細胞胚胎發(fā)生也經(jīng)常在不同階段要改變氮源的類型和比例等。基本培養(yǎng)基種類也可能影響到生長調(diào)節(jié)物質(zhì)的作用效果，因此需要考慮不同基本培養(yǎng)基與不同濃度的生長調(diào)節(jié)物質(zhì)之間的互作。

通常在對一種植物進行組織培養(yǎng)前，首先應查尋同屬、同種或同品種植物組織培養(yǎng)的有關(guān)資料，參考前人的研究成果。無法查找到有關(guān)資料，可以一些的基本培養(yǎng)基如MS、WPM或B5等開始試驗。如果對現(xiàn)有的基本培養(yǎng)基的篩選效果不理想，可以以MS、WPM或B5等基本培養(yǎng)基為基礎(chǔ)進行改良，改良的方法一般有以下幾種：

 （1）將基本培養(yǎng)基的大量成分或無機鹽成分減半至減四分之三（1/2，1/3，2/3，1/4，或3/4），或不同基本培養(yǎng)基成分組合如將B5的無機鹽成分與MS的有機成分組合在一起等；
 （2）增減氮源水平及調(diào)銨態(tài)氮和硝態(tài)氮（銨鹽和硝酸鹽）的種類和比例，氮源通常對培養(yǎng)物的質(zhì)量和發(fā)育路線影響較大；
 （3）增加鈣鹽，以改善木本植物培養(yǎng)中的鈣缺乏；
 （4）附加*、氨基酸及有機添加物，這對營養(yǎng)需求復雜或難培養(yǎng)的植物較為有效；
 （5）對植物生長土壤及體內(nèi)營養(yǎng)物質(zhì)含量進行測定，給基本培養(yǎng)基改良提供參考；
 （6）將無機鹽、有機成分及生長素和細胞分裂素劃分為高、中、低三個水平，進行81（34）種組合試 驗，這樣更為。總之，可通過培養(yǎng)基質(zhì)量（成分）和數(shù)量（濃度）調(diào)整，優(yōu)化和選擇與既定植物材料的特定要求相適合的基本培養(yǎng)培養(yǎng)基。

     植物組織培養(yǎng)基中經(jīng)常改變的因子是生長調(diào)節(jié)物質(zhì)，尤其是生長素和細胞分裂素。生長素和細胞分裂素的種類、數(shù)量和比例通常根據(jù)經(jīng)驗或激素的性質(zhì)與功能確定。但更科學的方法是采用單因子試驗法和多因子試驗法（正交設(shè)計），這樣可以采用生物統(tǒng)計學方法對結(jié)果進行分析。如以一種基本培養(yǎng)基為基礎(chǔ)，將生長素（如NAA）和細胞分裂素（如BA）各以 9種濃度水平（0、0.5、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0 mg/l）組合成81種處理，可以得到的生長素和細胞分裂素濃度水平的組合。正交設(shè)計雖然科學合理，考慮到了兩類激素之間的互作，但工作量較大。

     實踐中也可以采用固定生長素濃度，改變細胞分裂素種類或濃度，選擇*的細胞分裂素種類和濃度；以及反過采用同樣的方法也可對生長素進行選擇。或者有時為減少工作量，可代表性地配制數(shù)量較少的幾種組合（如生長素濃度相對高的一種，細胞分裂素濃度高的一種，生長素和細胞分裂素相平衡的一種），首先確定那類較為適合，然后根據(jù)適合的一類，利用單因子或多因子試驗法進一步確定zui適激素組合。確定zui適光照和溫度等因子的方法也同此。