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上海源葉生物科技有限公司
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閱讀:591發布時間:2015-11-4
細菌幾乎無處不在,可你有沒有想過,空間站中主要有哪些細菌?近日,美國國家 空*(NASA)下屬的噴氣推進實驗室(JPL)開展了一項研究,發現空間站中的細菌大多與皮膚相關,如放線菌。他們在《Microbiome》上發表了這一成果。
噴氣推進實驗室的Kasthuri Venkateswaran及其同事收集了空間站(ISS)以及JPL兩個凈室的灰塵樣本,這兩個凈室主要用于航天器部件的組裝。通過細菌培養和定量PCR分析,研究小組估計了微生物群體,并利用測序鑒定出兩個環境下的微生物組。
定量PCR分析表明,空間站的樣本有著zui高的細菌密度。不過在經過PMA處理后,這種差異就不再明顯。ISS HEPA樣本中的活細菌比例是1.7%,ISS真空樣本中的活細菌為2.7%,凈室JPL-103中的活細菌為4.5%。然而,另一個凈室JPL-SAF中活細菌的比例高達66.8%。
通過細菌培養,研究人員鑒定出41個細菌菌株,其中大多數屬于厚壁菌,少數屬于變形菌。他們指出,桿菌在兩個ISS樣本中占優勢,不過葡萄球菌只存在于真空樣本中。他們補充道,凈室樣本中缺乏或很少有這兩個屬。
通過羅氏-454的焦磷酸測序,Venkateswaran及其同事產生了大約10萬條細菌序列,讀長超過500 bp。在利用PMA去除死細胞后,ISS真空樣本有著zui高的序列數量,超過3萬條,而HEPA過濾器樣本的數量zui低。研究人員指出,HEPA過濾器的幾乎所有序列都屬于棒狀桿菌,這也存在于真空樣本中。
Illumina MiSeq系統上的測序又產生了680萬條序列。通過這些序列,研究人員發現,ISS樣本以放線菌、桿菌和梭菌為主,而凈室樣本則含有高水平的α-變形菌和γ-變形菌。研究人員認為,空間站和凈室樣本之間的差異是明顯的。
利用焦磷酸測序,Venkateswaran及其同事還發現了35,000條真菌序列,其中大部分屬于座囊菌綱、散囊菌綱和銀耳綱。他們指出,真菌的豐富度與位置有很大關系,在凈室中大多為座囊菌和散囊菌,而ISS樣本中含有更多散囊菌和酵母菌等。
總的來說,Venkateswaran及其同事報告稱,空間站和凈室中的微生物群落存在明顯的差異。空間站的樣本以放線菌為主,這可能是因為宇航員在那里生活。而凈室中的放線菌數量則通過更衣過程來降低。
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