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“蛋白”基因功能

時間:2016/6/23閱讀:604
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蛋白基因(蛋白)常見的功能分析方法有:代謝信號通路(pathway)和GO(Gene ontology,基因本體論)分析。另外還有COG(Clusters of Orthologous Groups of proteins)、蛋白功能域(protein Domain)等分析。

功能分析的應(yīng)用非常普遍,以通路分析為例,其相關(guān)的文獻(xiàn)逐年增加,2015年相關(guān)的文獻(xiàn)有42926篇(圖1所示)。 所以說基因功能分析是一個非常普遍而且重要的分析內(nèi)容。

蛋白GO和pathway都是研究基因功能的,那么它們的區(qū)別是什么呢?在這里跟小伙伴們科普一下:GO主要是研究基因功能的,而pathway是研究基因和蛋白功能的,是不是一目了然了?GO功能主要分成三大類:BP(生物學(xué)過程)、MF(分子功能)和CC(細(xì)胞組成);其中zui常用的就是GO BP分析。常見的pathway數(shù)據(jù)由KEGG、Reactome、Biocarta等。

 

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